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2004年，在市政府领导和市民政局等政府部门的支持下，市交通运输局组建的深圳市航空运输业协会正式成立，是国内第一家综合性航空业协会。协会创始会员包括深圳机场集团、民航深圳空中交通管理站、邮政速递、深圳航空、南航深圳分公司、顺丰速运、UPS、DHL、腾邦、联运通等企事业单位90余家。2015年7月，经市民政局批准，协会正式更名为“深圳市航空业协会”，英文名为SHENZHEN AVIATION ASSOCIATION (SZAA)。发展至今，协会会员单位涵盖民航运输业、通用航空业、航空航天业。
深圳市航空业协会的主管单位是深圳市交通运输局；行业管理单位是中国民用航空深圳安全监督管理局;社团登记单位为深圳市民政局社会组织管理局，同时接受中国航空运输协会的业务指导。
协会宗旨遵守国家的宪法、法律、法规，以市场化为导向，贯彻和执行国家及深圳市的行业法规及相关政策，努力为会员服务，协调企业之间的关系，促进行业相互沟通，优势互补，信息交流，维护行业经营秩序和利益，提高行业竞争水平，向政府有关部门反映行业情况和建议，参与对全行业的自律监督，促进航空运输行业的健康、持续发展。
深圳市航空经营范围包括行业协调、会员服务咨询、行业自律、行业调研、行业标准及技术推广、航空信息交流、人才培训培养志愿者服务等。